通過攝取甲醛在食物中的殘留物，我們會增加甲醛在體內的含量。美國食品與藥物管理局準許在禽類和奶牛的飼料中使用甲醛。在動物飼料中，甲醛被當做一種抗菌劑（尤其是沙門氏菌和酵母菌）。（在發現飼料生產商使用甲醛來掩蓋谷物中像黃曲霉毒素之類的有害物質之后，丹麥開始禁止在飼料中添加甲醛。）美國食品與藥物管理局同樣也準許在供人類食用的動物飲用水中使用甲醛作為抗菌劑。

  奶牛的牛奶、血液和組織中存在甲醛殘留物，因為甲醛被當做殺菌劑使用。當甲醛用于防止氣體發酵時，某些奶酪中也會存在甲醛殘留物。奶酪成熟幾個月之后，可能無法檢測到甲醛，但由于甲醛屬于易反應物質，會與其他物質結合，形成具有不明毒性的穩定化合物。有時，有些被檢測的奶酪中所含的甲醛殘留物已超出允許范圍。
  多聚甲醛是甲醛的一種，它可以以顆粒狀使用，在楓糖漿制作過程中可插入楓樹的出液口。這種顆粒在出液口中可抑制細菌生長，否則這些細菌會干擾樹液流動。在楓糖漿加工過程中，可允許使用少量的多聚甲醛。